DOI: 10.25725/VET.SAN.HYG.ECOL.201901008
УДК 619:616-07; 577.21

Авторы

Н. Г. КОЗЫРЕВА, Л. А. ИВАНОВА, Т. В. СТЕПАНОВА, М. И. ГУЛЮКИН
ФГБНУ ФНЦ «ВСЕРОССИЙСКИЙ НАУЧНО-ИССЛЕДОВАТЕЛЬСКИЙ ИНСТИТУТ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНОЙ ВЕТЕРИНАРИИ ИМ. К.И. СКРЯБИНА И Я.Р. КОВАЛЕНКО РАН»

Аннотация

Охарактеризована впервые созданная собственная база данных ВИЭВ (БД ВИЭВ) нуклеотидных последовательностей гена pol ВЛКРС c различной географической локализацией возбудителя, массив которой составляет 56 нуклеотидных последовательностей. Обнаружена гомогенность исследуемой популяции ВЛКРС по гену pol, выявлены внутригрупповые эволюционные расстояния, степень внутригрупповой дивергенции по гену pol при этом составляет в среднем 2%. При получении новых знаний о генетической структуре выявленной популяции ВЛКРС БД ВИЭВ регулярно обновляется и актуализируется, охарактеризованные изоляты ВЛКРС регистрируются в международном банке данных – GenBank. Таким образом, депонирована 101 нуклеотидная последовательность. Создание БД вызвано необходимостью быстро и точно анализировать большой объем молекулярных данных в целях повышения эффективности молекулярно-генетического мониторинга и надзора за ретровирусной инфекцией.

Ключевые слова

база данных, генетическая информация, вирус лейкоза крупного рогатого скота, секвенирование, филогенетический анализ, провирусный ген pol.a