УДК 579.62; 639.2/.3
DOI: 10.36871/vet.san.hyg.ecol.202601012

Авторы

Дарья Дмитриевна Вилкова,
Михаил Николаевич Кутузов,
Череповецкий государственный университет, Череповец, Российская Федерация
Мария Алексеевна Белова,
Череповецкий государственный университет, Череповец, Российская Федерация; Российский экономический университет имени Г.В. Плеханова, Москва, Российская Федерация
Ольга Викторовна Новиченко,
Череповецкий государственный университет, Череповец, Российская Федерация; Астраханский государственный университет им. В.Н. Татищева, Астрахань, Российская Федерация

Аннотация

Чтобы предотвратить поступление на рынок некачественной или потенциально опасной рыбы, необходимо проводить бактериальный контроль на всех этапах от транспортировки до производства. В статье представлены результаты микробиологического анализа радужной форели (Oncorhynchus mykiss), проведенного с помощью секвенирования ДНК гипервариабельных регионов гена 16S рРНК. Методика нового поколения (Next Generation Sequencing: NGS) включала платформу Illumina MiSeq и биоинформатическую обработку полученных данных. В результате идентификационных исследований определено общее количество бактерий и их процентное содержание в образце. Наибольшее процентное соотношение микробиоты радужной форели наблюдается для Brevundimonas (42,32%), Brucella (14,08%), Pseudomonas (8,98%), Sphingobacterium (7,78%), Stenotrophomonas (7,04%).

Ключевые слова

радужная форель, Oncorhynchus mykiss, микрофлора, безопасность, полимеразная цепная реакция, аквакультура

Список литературы

  1. Технический регламент Таможенного союза «О безопасности пищевой продукции» (ТР ТС 021/2011).
  2. Chen Y.wen, Cai W.qiang, Shi Y. gang et al. Effects of different salt concentrations and vacuum packaging on the shelf-stability of Russian sturgeon (Acipenser gueldenstaedti) stored at 4 °C // Food Control. 2020. № 109. doi:10.1016/j.foodcont.2019.106865.
  3. Feng Y., Zuo Z., Xie G. et al. Combined Analysis of 16S RRNA Sequencing and Metabolomics Reveals the Growth-Promoting Mechanism of Compound Probiotics in Zig-Zag Eel (Mastacembelus armatus) // Aquaculture Reports. 2025. № 40. doi:10.1016/j.aqrep.2024.102571.
  4. El-Tras W.F., Tayel A.A., Eltholth M.M. et al. Brucella infection in fresh water fish: Evidence for natural infection of Nile catfish, Clarias gariepinus, with Brucella melitensis // Veterinary Microbiology. 2010. № 141. P. 321-325. doi:10.1016/j.vetmic.2009.09.017.
  5. López J.R., Diéguez A.L., Doce A. et al. Pseudomonas baetica sp. nov., a fish pathogen isolated from wedge sole, Dicologlossa cuneata (Moreau) // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2012. № 62(4). P. 874-882. doi:10.1099/ijs.0.030601-0.
  6. Duman M., Mulet M., Altun S. et al. The Diversity of Pseudomonas Species Isolated from Fish Farms in Turkey // Aquaculture. 2021. № 535. doi:10.1016/j.aquaculture.2021.736369.
  7. Zhang M., Li A., Xu S. et al. Sphingobacterium micropteri sp. nov. and Sphingobacterium litopenaei sp. nov., isolated from aquaculture water // International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 2021. № 71(11). doi:10.1099/ijsem.0.005091.
  8. Al-Jubouri M.O., Obead W.F., Salman S.A. A First Record of Sphingobacterium thalpophilum isolated from Coptodon zillii and Oreeochromis aureus in the Al-Diwaniya River/Iraq // In Proceedings of the IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. Institute of Physics. 2023. № 1259(1). P. 7. doi:10.1088/1755-1315/1259/1/012084
  9. Shahid S., Abid R., Ajmal W. et al. Antibiotic resistance genes prediction via whole genome sequence analysis of Stenotrophomonas maltophilia // Journal of Infection and Public Health. 2024. № 17(2). P. 236-244. doi:10.1016/j.jiph.2023.12.010.